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自建房可以注册营业执照。

需要注意的是，自建房办理营业执照的前提是该房屋具备合法的产权证明，并且满足安全、环保、消防等方面的要求，不同地区对于自建房办理营业执照的规定可能存在差异，具体还需根据当地政策和规定进行申请。

仅供参考，建议咨询当地的房屋管理部门和工商行政管理部门，了解详细的规定和流程。